Le rôle et les objectifs de l’Administration sont d’établir, d’exploiter, d’entretenir et d’administrer, pour la sécurité de la navigation, un service de pilotage marin complet et des services connexes qui sont efficaces et économiques dans ses limites géographiques, sous réserve de l’approbation par décret du gouverneur en conseil, conformément à la Loi sur le pilotage. Cela comprend l’établissement des zones de pilotage obligatoire, la détermination de navires ou catégories de navires assujettis au pilotage obligatoire, la détermination des catégories de brevets et certificats de pilotage, et l’établissement de tarifs de droit de pilotage à verser à l’Administration pour les services de pilotage.
Les limites géographiques de l’Administration comprennent toutes les eaux territoriales du Québec situées au sud de l’entrée septentrionale de l’écluse Saint-Lambert, et toutes les eaux canadiennes situées à l’intérieur et autour de l’Ontario et du Manitoba. Le pilotage dans les eaux internationales qui se trouvent à l’intérieur de ces limites est partagé avec les sociétés de pilotage des États-Unis qui sont dirigées par la Garde côtière de ce pays, conformément à la convention signée par le Canada et les États-Unis.
En vertu de la Loi sur le pilotage, l’Administration prescrit des tarifs de droit de pilotage fixés à un niveau qui permet l’Administration d’exploiter sur une autonomie financière qui doivent être équitables et raisonnables.